צוות המחקר אחראי לכל פעילויות המחקר המתבצעות במרכז, כולל גיוס משפחות למגוון מחקרים, איסוף מידע נרחב מהילדים ומהוריהם וארגון כל המידע במאגר נתונים חדיש המבטיח את סודיות המידע על המטופל. צוות המחקר משולב בפעולות קליניות יומיומיות ביחידה לפסיכיאטריה לגיל הרך, במכון להתפתחות הילד במרכז  הרפואי סורוקה ובמרכז להתפתחות הילד של משרד הבריאות.

​

כך מתאפשר להם לפגוש את המשפחות במהלך המפגשים הראשונים בהם ניתנת האבחנה הראשונית של האוטיזם ובהמשך אף ללוות

אותם בבדיקות המעקב, דבר המקל על גיוס המשפחות ואיסוף המידע. דגש מיוחד ניתן על איסוף רוב רובו של המחקר (שאלות להורים, בדיקות גנטיות על ידי דגימות רוק ומעקב אחר תנועות עיניים), במהלך או מיד לאחר הביקורים הקליניים. מתקני מחקר נוחים הכוללים חדרי משחק לילדים ממוקמים בצמוד לחדרים הקליניים וכך מאפשרים לצוות המחקר לאסוף את המידע ביעילות ממשפחות מרקע סוציו-דמוגרפי, תרבותי וגנטי נרחב, כולל מיעוטים, אשר בדרך כלל אינם מיוצגים במאגרי נתונים אחרים של אוטיזם.

​